A l'emplacement de l'église se trouvait avant l'édification de l'abbaye Saint-Denis, une chapelle dédiée à sainte Marie-Madeleine. La construction de l'église a commencé au XVème siècle et s'est poursuivie au XVIème.
L'église était réservée aux paroissiens du bourg saint-Denis, qui n'avaient pas l'autorisation des moines de se rendre pour les offices quotidiens à l'abbaye toute proche. La cloche : Marie-Joseph date de 1857 et pèse 1.050kg.
A l'intérieur, les piliers sont d'un coté octogonaux et de l'autre cylindriques. L'on y trouve une statuaire très riche, un Christ en croix du XIVe siècle fait de bois sculpté, et de très nombreux tableaux.
La Mise au Tombeau (XVème siècle Ecole d'Auxerre) a été apportée dans l'église, elle se trouvait auparavant dans l'église Notre-Dame des Marais détruite à la fin du XVIIIème siècle. Sa dernière restauration date de 1964 et a occasionné de nombreuses modifications.
En 1250 il y avait 310 paroissiens, en 1737 : 1300 habitants.
L'église est ouverte pendant les offices
Programme de restauration de l'église Saint-Hilaire Lire l'article